Stojąc tyłem do ołtarza głównego, mamy widok na prospekt organowy. Instrument ten wzmiankowany był po raz pierwszy w 1699 r. Miał 14 głosów. Pierwotny barokowy prospekt z końca XVII w. był wprawdzie niewielki (zajmował zaledwie 1/3 długości chóru), ale miał bogate zdobienia.

W zwieńczeniu umieszczone zostały figury króla Dawida grającego na harfie i dwóch muzykujących aniołów, a u dołu pochylonego anioła podtrzymującego cały prospekt. Podczas remontu kościoła (prowadzonego od 1969 r.) przebudowane zostały organy, ponieważ według ks. dra Jana Chwałka w ówczesnym stanie nie przedstawiały większej wartości muzycznej ani technicznej. Ponadto ich rozmiary architektonicznie i brzmieniowo były zbyt szczupłe dla wnętrza monumentalnej świątyni. Prospekt został zatem rozbudowany, a wykorzystano przy tym wszystkie elementy ze starego wystroju. Instrument otrzymał nowe dyspozycje głosowe i obecnie posiada 40 głosów.